Claude помог раскрыть строение белковой частицы

Биологи Anthropic с помощью Claude впервые определили трёхмерную структуру частицы vault из белка бактериофага. Такие полые белковые оболочки известны у многих организмов, но их функция остаётся неясной.

Учёные искали родственников белков vault среди примерно 15 млрд предсказанных белков. После проверки 44 кандидатов в бесклеточной системе 24 отобранных белка попробовали получить в бактериях Escherichia coli. Растворимый белок удалось получить для 15 кандидатов. Семь из этих белков образовали частицы, похожие на vault. Криоэлектронная микроскопия подтвердила их форму для четырёх белков: двух бактериальных и двух фаговых.

Вместо трёхдневного выделения частиц центрифугированием в растворе сахара команда пропускала содержимое разрушенных клеток через колонку с пористыми гранулами. Крупные частицы vault не проникали в поры и выходили первыми. Claude помог выбрать колонку и способы проверки частиц, а также предложил обойтись без предварительной очистки. Подготовка образца для микроскопии заняла около 90 минут.

Частица из фагового белка L05 состоит из 96 его копий против 78 у млекопитающих. Она короче и шире, а её внутренний объём примерно на 25% больше. Исследователи создали 15 изменённых версий белка. Некоторые изменения мешали оболочке замкнуться, а удвоение двух повторяющихся участков её стенки увеличило внутренний объём примерно на 20%.

Под руководством учёных Claude также готовил последовательности ДНК для получения выбранных белков в бактериях и обрабатывал данные микроскопии. Первую полную модель строения частицы получили через 34 часа после начала обработки данных. Anthropic сообщила о результатах до публикации препринта; биологическая функция vault остаётся неизвестной.

Ранее по теме: Искусственный интеллект помог создать молекулы против яда скорпиона

Источник: Anthropic