Разгадана 40-летняя загадка: вирус кишечника атакует бактерии

Учёные из Вашингтонского университета установили, что пикобирнавирус заражает бактерии кишечника, а не клетки человека

Открытие, опубликованное 29 октября в журнале Nature Microbiology, меняет представление о роли пикобирнавирусов в экосистеме кишечника. Эти вирусы оказались третьим известным семейством РНК-вирусов, поражающих бактерии.

Почти 40 лет учёные считали, что пикобирнавирусы напрямую атакуют клетки человека и вызывают кишечные заболевания — их обнаруживали в образцах кала пациентов с диареей. Вырастить вирус в лаборатории не удавалось. Подсказку дали новые технологии секвенирования: генетический материал вируса неожиданно нашли при изучении микроскопического круглого червя Caenorhabditis elegans. Черви питаются бактериями, а в кишечнике человека их триллионы — так появилась гипотеза, что вирус заражает именно бактерии.

Чтобы её проверить, исследователи ввели образцы стула человека мышам без микробов и впервые получили лабораторную модель, в которой вирус активно размножался. Затем они вырастили его в чашках с кишечными бактериями без доступа кислорода. Клетки млекопитающих в таких условиях не выживают, поэтому рост вируса в течение 20 дней указывал на то, что он размножается внутри бактерий. Антибиотики, уничтожавшие бактерии, останавливали и размножение вируса. С помощью молекулярной визуализации и сортировки клеток пикобирнавирусы нашли внутри новой кишечной бактерии, которую назвали Candidatus Anaerotignum faecalis.

Присутствие пикобирнавирусов в кишечнике связывают с острой диареей, диабетом 1-го типа и реакцией «трансплантат против хозяина» — осложнением после пересадки стволовых клеток. Вирус может вредить, и не заражая клетки человека: например, уничтожая полезные бактерии, на месте которых разрастаются вредные. Но, как предупреждает руководитель работы Дэвид Ван, высокий уровень вируса у больных ещё не доказывает, что он вызывает болезни, — возможно, он лишь маркер проблем с кишечником.

Ранее по теме: Учёные раскрыли механизм защиты бактерий от вирусов

Источник: EurekAlert!